La actual Facultad de Ciencias y Tecnología dependiente de la Universidad Autónoma Juan Misael Saracho, remonta sus orígenes fundacionales al año 1972, cuando con gran visión de futuro las autoridades universitarias y académicas de aquella época, en un 2 de junio de 1972 crearon la Facultad de Ciencias Puras y Naturales, cuya misión fundamental era otorgar formación básica en el área de ciencias matemáticas, química y física, principalmente, a estudiantes que una vez vencidos los primeros semestres continuarían sus estudios en las ramas de Ingeniería, o en el área de las Ciencias Naturales en otras universidades del interior del país.

Sin embargo, pocos años después, durante la reunión Sectorial de Tecnología, Politécnicos y Ciencias Puras convocada por el Comité Ejecutivo de la Universidad Boliviana en la Universidad Técnica de Oruro, entre el 9 y 12 de agosto de 1979, se resuelve apoyar la creación de la Facultad de Ciencias y Tecnología en Tarija – al mismo tiempo que en Cochabamba – con las carreras de Ingeniería Civil e Ingeniería Química creadas oficialmente un 4 de octubre de 1979 mediante RHCU de la UAJMS Nº.- 064/79. El cambio de nombre de la Facultad de Ciencias Puras y Naturales por el de Facultad de Ciencias y Tecnología se da recién a partir del mes de mayo de 1982; no obstante, tradicionalmente se reconoce como fecha de su creación el año 1979, coincidentemente con la creación de las carreras de Ing. Química e Ing. Civil.

Dichas carreras se sumaron así a la carrera de Tecnología de Alimentos – nivel de Técnico Superior- que ya había sido creada el año 1976. Esta carrera se transformaría en el año 1979 a Técnico Superior en Industrias de la Alimentación, luego en Tecnología de Alimentos y, a partir del año 1992, como Ingeniería de Alimentos (RHCU Nº 055/92). La Carrera de Ingeniería de Alimentos adopta, a partir del año 1984, como fecha de celebración de su aniversario el 16 de octubre, en conmemoración al día Mundial de la Alimentación.

Dada la creciente necesidad de formar recursos humanos en el ámbito de las Nuevas Tecnologías de Información y Comunicación, un 5 de junio de 1990 se crea la carrera de Informática (RHCU Nº. 042/90) con los niveles de Licenciatura en Informática y de Técnico Superior en Análisis de Sistemas. Posteriormente, a partir del año 1997, la misma se transforma en Ingeniería Informática.

El 11 de noviembre de 1999, mediante RHCU Nº. 164/99, se crea una nueva carrera con el nombre de Arquitectura y Urbanismo, actualmente denominada como Arquitectura, con la finalidad de formar recursos humanos orientados a preservar el arte y el desarrollo y promoción del ámbito urbano.

Dentro el marco de las políticas de expansión y desconcentración de la educación superior, hacia las provincias, que oferta la UAJMS y la propia Facultad de Ciencias y Tecnología, el año 2002 se crea la Carrera de Técnico Superior en Informática en la ciudad de Bermejo, misma que a partir del año 2006 eleva su nivel a Licenciatura en Ingeniería de Sistemas.

Así también, dado el importante potencial hidrocarburífero descubierto en el departamento de Tarija, particularmente en las provincias de Gran Chaco y O`Connor, el año 2006 inician sus actividades académicas los primeros años de las Carreras de Ingeniería Petroquímica e Ingeniería de Gas y Petróleo en la ciudad Benemérita de Villamontes, constituyéndose así en las carreras benjamines de la Facultad de Ciencias y Tecnología.

Objetivos Generales

Formación integral y educación continúa de la persona Fortalecimiento de la investigación  científica y tecnológica orientada al desarrollo sostenible Desarrollo y diversificación de los  vínculos de la universidad con la sociedad

Mejoramiento continuo de la calidad en la gestión universitaria Fortalecimiento de las relaciones de cooperación regional, nacional e internacional, en los ámbitos de la investigación, la extensión y la docencia.